オプションでの難易度設定は「UM」と「ネオジオモード」でそれぞれ個別にあるのだが、両者が妙な干渉を起こしており実際の難易度設定が「両方を足し合わせた値」になってしまっている。最大値が「7」で、それを超えると逆順に数値が下がる。
例として、それぞれのデフォルトである4・4のときは合計が4+4で8になるが、実質的には7から1つ下がった「6」になる。ネオジオモードの難易度設定を4のまま弄らずに「UM」側の難易度を7に上げると7+4で11になり7から4つ下がって「3」、逆に1に下げると1+4で「5」になる。
難易度を最高の「7」にしたい場合はUM3、ネオジオモード4など合計7になる組み合わせに、逆に最低の「1」にしたい場合はUM7、ネオジオモード6など合計が13になる組み合わせにするといい
注記:上記の不具合はPS2版やPS3のゲームアーカイブ版のみであり、XBLA版やsteamの98UMFEでは修正されています